Родилась 13 июля 1922 г. в с. Усть-Каменка Тогучинского района Новосибирской области в крестьянской семье. Окончила 4 класса начальной школы, работала в колхозе, а в 1939 – 1941 г. — рабочая столовой. В 1942 г. вступила в добровольческую Сибирскую стрелковую дивизию. Стала связисткой. Участвовала в боевых действиях на Западном фронте. Затем оказалась в 7-й Гвардейской Севастопольской штурмовой авиационной дивизии. Это соединение имело громкую боевую славу.
Боевой путь Анны Филипповны завершился в мае 1945 г., демобилизовалась в 1946 г. Ее боевые заслуги отмечены орденом Отечественной войны II степени, медалями «За боевые заслуги», «За победу над Германией в Великой Отечественной войне 1941 – 1945 гг.», юбилейными.
После демобилизации Анна Филипповна Ягунова работала: в 1946 – 1948 гг. — в коллективе Новосибирского технического участка, в 1949 – 1951 гг. — в городской больнице № 2, в 1959 – 1975 гг. — на базе посылторга Новосибирского облпотребсоюза.
В 1975 г. с мужем Иваном Андреевичем Ягуновым пришла работать в спортивно-оздоровительный лагерь «Кирза». Она многое сделала для благоустройства лагеря, по-матерински относилась к отдыхающим здесь студентам и преподавателям. С супругом Иваном Андреевичем воспитала сына и дочь.